Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms