Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms