Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Trbv19A0A0B4J1H4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv19A0A0B4J1H4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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