Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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