Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms