Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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