Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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