Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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