Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCIRG1Q13488 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms