Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXF2Q12947 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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