Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Speer3W4VSP1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer3W4VSP1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms