Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer1Q9Z2Y3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms