Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn8Q9Z260 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms