Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip6Q9Z1Y4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms