Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl27Q9Z1X0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms