Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs4Q9Z1T2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs4Q9Z1T2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms