Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms