Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf1Q9Z1B8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms