Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Skp2Q9Z0Z3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Skp2Q9Z0Z3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms