Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn3Q9Z0Y1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn3Q9Z0Y1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms