Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gipc1Q9Z0G0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gipc1Q9Z0G0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gipc1Q9Z0G0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gipc1Q9Z0G0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms