Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp2Q9Z0E6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms