Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AireQ9Z0E3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms