Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ap4s1Q9WVL1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms