Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slit3Q9WVB4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slit3Q9WVB4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms