Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stxbp4Q9WV89 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Stxbp4Q9WV89 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms