Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec2Q9WV35 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms