Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Opn3Q9WUK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms