Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms