Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lemd3Q9WU40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd3Q9WU40 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms