Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn5Q9WU28 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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