Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms