Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkraQ9WTX2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms