Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6cQ9WTM3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms