Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam50bQ9WTJ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam50bQ9WTJ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms