Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sorbs3Q9R1Z8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms