Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hic1Q9R1Y5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hic1Q9R1Y5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms