Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N3

Syt11, Synaptotagmin-11, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt11Q9R0N3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt11Q9R0N3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms