Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NrkQ9R0G8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrkQ9R0G8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms