Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Plod1Q9R0E2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plod1Q9R0E2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms