Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod3Q9R0E1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms