Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr54Q9R0D8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms