Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lamc3Q9R0B6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lamc3Q9R0B6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms