Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nubp2Q9R061 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nubp2Q9R061 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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