Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsjQ9R014 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms