Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atp11cQ9QZW0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp11cQ9QZW0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms