Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clcf1Q9QZM3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcf1Q9QZM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms