Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmlQ9QZD5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms