Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc4Q9QZD4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms