Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms